La constante humedad del suelo hace que El Carmen sea dueño de una rica Flora. Existen montañas vírgenes, no explotadas. Las especies endémicas son de inigualables belleza. Se encuentran infinidad de flores cuyos colores matizan con el verdor de los campos. La fauna también llama la atención en sus montañas existen venados,tigrillos,armadillos, monos,aves,reptiles,cusumbos y otras especies que casi han desaparecido por la depredación a las que han sometido los cazadores y comerciantes.
La guanta sigue siendo cazada y comercializada en el Cantón El Carmen, auque se lo hace en forma clandestina por estar en peligro de extinción.
